IncRNA PCR
長鏈非編碼RNA (long non-coding RNA，IncRNA) 是一類長度在200nt以上，不編碼蛋白的RNA分子。研究發(fā)現(xiàn)，lncRNA具有保守的二級結(jié)構(gòu)，可以與蛋白、DNA 和RNA相互作用，參與了X染色體沉默、基因組印跡、染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活或抑制、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N生物學(xué)過程的調(diào)控，與各種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，成為近年來非編碼RNA和表觀遺傳研究的熱點(diǎn)和重點(diǎn)。
附錄.如何開展lnc RNA研究？
01 差異lnc RNA篩選
去核糖體RNA法富集lncRNA進(jìn)行鏈特異建庫測序 基因編輯:CRISPR-Cas9 crRNA
文庫
02 生物信息分析
Inc RNA表達(dá)差異分析 新IncRNA預(yù)測 IncRNA-mRNA 共表達(dá)分析 IncRNA功能預(yù)測03 體外實(shí)驗(yàn)功能驗(yàn)證
功能獲得性研究：過表達(dá)載體 功能缺失性研究：siRNA,Smart Silencer,ASO IncRNA檢測：qPCR,FISH IncRNA功能驗(yàn)證RNA pull-down,CLIP-seq,ChIRP-seq,RIP-seq等 基因編輯：CRISPR-Cas9系列及配套產(chǎn)品
04 體內(nèi)實(shí)驗(yàn)功能驗(yàn)證
構(gòu)建動物模型 導(dǎo)入過表達(dá)載體、siRNA或ASO 檢測動物表型變化，生化指標(biāo)和相關(guān)基因表達(dá)可檢測樣本類型
里來結(jié)合在lncRNA研究領(lǐng)域多年的經(jīng)驗(yàn)，根據(jù)提取方式、建庫難度和類型不同，可提供多種lncRNA測序服務(wù)： 組織、細(xì)胞lncRNA測序 外泌體（Exosomes）lncRNA測序常規(guī)檢測流程
qRT-PCR技術(shù)以其高靈敏度及高準(zhǔn)確性，已成為RNA表達(dá)豐度檢測的一個重要標(biāo)準(zhǔn)，二代測序及芯片數(shù)據(jù)往往都需要qRT-PCR檢測進(jìn)行驗(yàn)證，常規(guī)實(shí)驗(yàn)中的相對定量檢測或絕對定量檢測，qRT-PCR也是最合適的方法。
目前數(shù)據(jù)庫對lncRNA序列的收錄及注釋都不完備，大部分lncRNA的表達(dá)豐度也比較低，對lncRNA引物設(shè)計(jì)策略及qRT-PCR檢測提出了一定的挑戰(zhàn)。
lnkRNA需使用專用引物與專用試劑盒，詳情請咨詢。
目前數(shù)據(jù)庫對lncRNA序列的收錄及注釋都不完備，大部分lncRNA的表達(dá)豐度也比較低，對lncRNA引物設(shè)計(jì)策略及qRT-PCR檢測提出了一定的挑戰(zhàn)。
lnkRNA需使用專用引物與專用試劑盒，詳情請咨詢。
引物設(shè)計(jì)
RNA提取和逆錄轉(zhuǎn)
Real-time RCP
數(shù)據(jù)分析
完成
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